长期从事风湿临床免疫基础和临床研究。首次发现：新生抗原介导了强直性脊柱炎发病，是该领域里程碑式重大发现（Science，2023）；类风湿关节炎滑膜中铁死亡机制；CD147是病毒和疟原虫入侵人体新受体。研发成功抗恶性疟疾和重症新冠病毒感染特异创新；建立了炎性关节炎内外科综合诊疗关键技术体系，首先提出“AS合并髋关节炎MRI评估标准”，主持建立《ANCA检测技术》和《中轴型脊柱关节炎综合评估》中国专家共识。
以/通讯作者发表SCI论文117篇，其中Science、Cell Metab等IF 20以上国际顶刊9篇，IF 10以上13篇，ESI前1‰热点论文1篇、前1%高被引论文3篇；授权国际国内专利18项；承担973、863、国科金重点等重大项目12项；获国家一类新药证书及上市许可1项，军特药证书及生产许可1项；获国家二等奖2项、省部级一等奖7项；主编教材专著4部；3次入选全国医药卫生/中国医药生物技术十大进展。
1993年12月，时任传染科副主任医师、副教授的朱平已在传染病领域积累了丰富的临床经验，关于流行性出血热发病机制的研究项目获得军队科技进步二等奖，但她毅然服从医院发展需要的安排，调任至彼时“一穷二白”的免疫科，从头做起。
朱平医术精湛，不少省外患者慕名而来。她总是说：“他们来一次不容易，能少跑一趟是一趟，能省住宿费就省。”为了给患者减轻经济负担，她仔细分析病情，确立完善的诊疗方案，让病人少花钱、少奔波。每逢坐诊，她常常自愿延长门诊时间，态度和善、耐心细致地接待完后一名患者才下班。